C. difficile Sporen liegen im Inneren des Dickdarms lange ruhen, bis eine Person nimmt ein Antibiotikum. Das Antibiotikum stört die anderen Bakterien, die normalerweise im Dickdarm leben und Verhütung von C. difficile Umwandlung in seine aktive, bakterielle Krankheit verursachen, zu bilden. Als Folge wandelt C. difficile in ihre infektiöse Form und dann produziert Giftstoffe (Chemie), die Schäden zu schüren und den Dickdarm. Die Entzündung führt zu einem Zustrom von weißen Blutzellen, den Doppelpunkt. Der Schweregrad der Colitis kann variieren. In den schweren Fällen, töten die Gifte des Gewebes der inneren Auskleidung des Dickdarms, und das Gewebe fällt ab. Das Gewebe, das aus fällt, ist mit weißen Blutkörperchen (Eiter gemischt) und gibt das Erscheinen eines weißen, häutigen Patch für die innere Auskleidung des Dickdarms. Diese schwere Form von C. difficile Colitis heißt pseudomembranöse Kolitis, weil die Patches wie Membranen erscheinen, aber sie sind nicht wahr Membranen.
Nicht jeder mit C. difficile infiziert entwickelt ulcerosa. Viele Säuglinge und Kleinkinder, und sogar einige Erwachsene, sind Träger (sie infiziert sind, haben aber keine Symptome) von C. difficile. C. difficile verursacht keine Kolitis in diese Leute wahrscheinlich, weil;
1. Die Bakterien bleiben in dem Doppelpunkt als nicht-aktive Sporen, und
2. Die Individuen sind Antikörper, die sie schützen gegen die C. difficile Toxine entwickelt.