Die Mehrheit der Menschen, die sich mit der Coccidioides Pilzen infiziert haben eine gute Prognose, wie die Infektion ist in der Regel selbstlimitierend. Manche Menschen mit selbst limitierende Erkrankung kann ein paar kleine verkalkten Bereichen in der Lunge zu erhalten, aber diese oft keine Probleme für die Person. Chronische Krankheit kann mehr Knoten und Hohlräume in der Lunge erzeugen, und nehmen ein oder zwei Jahre zu lösen, aber in der Regel ist die Prognose für viele Patienten gut.
Allerdings haben Menschen mit Diabetes oder ältere Menschen ein nur eine angemessene Prognose, da sie fortschreitende Lungenerkrankung mit Symptomen können (Atemnot entwickeln, Lungenfibrose, und Hohlräume in der Lunge), die seit Jahren bestehen. Progressive Kokzidioidomykose hat eine schlechte Prognose. Etwa 1% der Patienten mit hohem Risiko (in der Regel immunsupprimierten aufgrund von HIV, Krebs oder Chemotherapie) für die Entwicklung Kokzidioidomykose verbreitet, und diese Patienten haben eine ernste Prognose. Patienten mit einer disseminierten Kokzidioidomykose kann rasche Entwicklung aller oben genannten Beschwerden haben und sterben, wenn die Krankheit nicht angemessen und rasch behandelt werden.
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